237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2959 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  94.91 
 
 
511 aa  1009    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  61.57 
 
 
505 aa  647    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  79.49 
 
 
509 aa  850    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  79.49 
 
 
509 aa  850    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  79.68 
 
 
509 aa  852    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  79.68 
 
 
509 aa  852    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  79.68 
 
 
509 aa  852    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  79.49 
 
 
509 aa  850    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  61.1 
 
 
505 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  78.9 
 
 
509 aa  842    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  78.11 
 
 
509 aa  831    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  79.68 
 
 
509 aa  852    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  80.87 
 
 
509 aa  862    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  79.49 
 
 
509 aa  852    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  100 
 
 
512 aa  1054    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  61.1 
 
 
505 aa  642    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  60.83 
 
 
521 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  58.74 
 
 
513 aa  630  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  60 
 
 
514 aa  624  1e-178  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  60.51 
 
 
512 aa  625  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  58.01 
 
 
516 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  57.45 
 
 
512 aa  616  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  58.91 
 
 
512 aa  608  1e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  58.53 
 
 
512 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  57.4 
 
 
509 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  56.95 
 
 
513 aa  596  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  57.73 
 
 
511 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  58.09 
 
 
511 aa  587  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  56.81 
 
 
517 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  56.16 
 
 
505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 
516 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  56.12 
 
 
512 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 
515 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  54.97 
 
 
511 aa  565  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
510 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  54.93 
 
 
514 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 
512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  55.84 
 
 
512 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  52.77 
 
 
525 aa  558  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  53.82 
 
 
512 aa  554  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  54.49 
 
 
513 aa  553  1e-156  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  53.59 
 
 
509 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  55.1 
 
 
510 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 
516 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.95 
 
 
513 aa  539  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  54 
 
 
512 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
516 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  52.45 
 
 
514 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  52.52 
 
 
518 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  49.72 
 
 
538 aa  536  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
516 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
516 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  54.4 
 
 
513 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 
518 aa  525  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
515 aa  522  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 
519 aa  522  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  53.45 
 
 
509 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  53.45 
 
 
509 aa  524  1e-147  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  50.77 
 
 
524 aa  519  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  49.04 
 
 
533 aa  518  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  51.17 
 
 
508 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
507 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
517 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  49.33 
 
 
532 aa  517  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 
524 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
514 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
514 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 
523 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 
514 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
514 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50 
 
 
532 aa  514  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1890  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 
540 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
514 aa  512  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
514 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
514 aa  512  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
505 aa  511  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
514 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
514 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
514 aa  511  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
511 aa  508  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
513 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
514 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
514 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
514 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50.29 
 
 
510 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  50.87 
 
 
521 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
514 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
511 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
514 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
511 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
516 aa  502  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  49.03 
 
 
510 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>