238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3203 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  77.15 
 
 
513 aa  783    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  61.96 
 
 
514 aa  641    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  71.4 
 
 
512 aa  758    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  100 
 
 
512 aa  1048    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  72.94 
 
 
512 aa  783    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  61.45 
 
 
513 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  71.71 
 
 
512 aa  760    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  73.87 
 
 
512 aa  787    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  74.12 
 
 
510 aa  787    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  60.7 
 
 
512 aa  634  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  59.57 
 
 
512 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  59.38 
 
 
512 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  57.65 
 
 
512 aa  627  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 
516 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  57.34 
 
 
516 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  57.42 
 
 
516 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  58.12 
 
 
511 aa  610  1e-173  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  58.74 
 
 
511 aa  609  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  58.15 
 
 
516 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  57.93 
 
 
516 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  59.96 
 
 
511 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  58.58 
 
 
513 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  58.63 
 
 
516 aa  598  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  57 
 
 
509 aa  595  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  57.71 
 
 
514 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  55.99 
 
 
510 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  55.81 
 
 
518 aa  588  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  55.15 
 
 
513 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  56.1 
 
 
511 aa  580  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  56.14 
 
 
517 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  56.84 
 
 
514 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  54.98 
 
 
525 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 
511 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 
508 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  56.19 
 
 
515 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  56.64 
 
 
505 aa  566  1e-160  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  56.08 
 
 
511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  54.71 
 
 
515 aa  565  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  56.19 
 
 
515 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 
511 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 
518 aa  561  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  55.19 
 
 
510 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 
509 aa  555  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  54.01 
 
 
515 aa  552  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  54 
 
 
512 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 
529 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  55.8 
 
 
511 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 
510 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  54.03 
 
 
524 aa  551  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  55.66 
 
 
511 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  54.49 
 
 
511 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 
513 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 
511 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  52.95 
 
 
513 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  55.6 
 
 
521 aa  541  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 
514 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  53.67 
 
 
525 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  52.34 
 
 
509 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 
520 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  52.54 
 
 
509 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  52.54 
 
 
509 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  52.54 
 
 
509 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  52.54 
 
 
509 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  52.54 
 
 
509 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  52.54 
 
 
509 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  52.34 
 
 
509 aa  536  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0439  phosphoglyceromutase  53.96 
 
 
557 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 
538 aa  537  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 
514 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  52.54 
 
 
509 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  53.44 
 
 
514 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 
514 aa  538  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1776  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 
523 aa  534  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.403948  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 
509 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  53.44 
 
 
514 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 
514 aa  534  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  53.86 
 
 
521 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 
514 aa  534  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 
514 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  52.15 
 
 
509 aa  531  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  53.62 
 
 
510 aa  535  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 
514 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  53.44 
 
 
513 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  52.93 
 
 
514 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 
517 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 
514 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.53 
 
 
532 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 
509 aa  531  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  51.96 
 
 
514 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 
514 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 
514 aa  527  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  51.56 
 
 
533 aa  527  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  52.14 
 
 
532 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 
514 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  52.16 
 
 
514 aa  526  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 
514 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 
514 aa  526  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>