253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0135 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  62.62 
 
 		 512 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  64.3 
 
 		 513 aa  692    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  60.59 
 
 		 513 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  62.33 
 
 		 509 aa  652    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 516 aa  1073    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  76.55 
 
 		 516 aa  849    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  60.08 
 
 		 512 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  59.88 
 
 		 512 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  59.22 
 
 		 511 aa  616  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  59.17 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  59.8 
 
 		 511 aa  610  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  57.06 
 
 		 512 aa  596  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  58.86 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  58.63 
 
 		 512 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  56.54 
 
 		 518 aa  590  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  57.89 
 
 		 514 aa  588  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 		 510 aa  591  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  57.37 
 
 		 511 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 		 512 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  55.69 
 
 		 511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  57.93 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  57.53 
 
 		 512 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  58.15 
 
 		 513 aa  580  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  57.28 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  55.51 
 
 		 509 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  55.31 
 
 		 509 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  55.12 
 
 		 509 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 		 509 aa  568  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 		 509 aa  568  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 		 509 aa  568  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  56.56 
 
 		 517 aa  568  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 		 509 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  56.1 
 
 		 515 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  54.72 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  54.6 
 
 		 513 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 		 516 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 		 509 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 		 509 aa  567  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  56.3 
 
 		 512 aa  565  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  55.31 
 
 		 521 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  54.65 
 
 		 525 aa  561  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  54.33 
 
 		 514 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  53.14 
 
 		 515 aa  551  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 516 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  54.33 
 
 		 511 aa  549  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 		 513 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  51.28 
 
 		 516 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  54.81 
 
 		 509 aa  545  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  53.4 
 
 		 514 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 		 529 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  53.55 
 
 		 521 aa  541  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 		 511 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  54.07 
 
 		 519 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  53.24 
 
 		 510 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 508 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  53.01 
 
 		 514 aa  538  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 		 515 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  52.23 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 		 514 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 513 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 		 514 aa  535  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  52.82 
 
 		 514 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 510 aa  532  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  52.23 
 
 		 515 aa  533  1e-150  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  52.85 
 
 		 510 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 517 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 518 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  53.05 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 514 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 514 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 509 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 511 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 		 511 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  51.17 
 
 		 520 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 515 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 		 511 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  52.85 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 532 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 514 aa  524  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 		 514 aa  525  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>