243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2574 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  64.3 
 
 
513 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  100 
 
 
514 aa  1058    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  61.96 
 
 
512 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  60.63 
 
 
512 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  62.01 
 
 
512 aa  645    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  62.75 
 
 
510 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  61.45 
 
 
512 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  60.24 
 
 
512 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  58.89 
 
 
511 aa  616  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  58.48 
 
 
513 aa  604  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  56.67 
 
 
516 aa  598  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  58.07 
 
 
505 aa  598  1e-170  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
516 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  57.53 
 
 
516 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  56.64 
 
 
512 aa  595  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  56.86 
 
 
516 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  54.62 
 
 
512 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  55.77 
 
 
510 aa  581  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  54.04 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 
512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 
512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  56.52 
 
 
509 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  55.05 
 
 
514 aa  569  1e-161  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  56.36 
 
 
511 aa  570  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  56.61 
 
 
511 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 
516 aa  568  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  54.81 
 
 
509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  55.95 
 
 
513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 
514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 
518 aa  564  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  54.33 
 
 
516 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  52.95 
 
 
511 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.02 
 
 
513 aa  557  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  52.36 
 
 
511 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  52.76 
 
 
511 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 
515 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  53.22 
 
 
517 aa  551  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  53.63 
 
 
515 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  55.73 
 
 
519 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  53.33 
 
 
514 aa  550  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 
525 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 
508 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  53.82 
 
 
511 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  52.45 
 
 
512 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  53.85 
 
 
524 aa  545  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  53.25 
 
 
511 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  52.27 
 
 
510 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 
511 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 
514 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  53.42 
 
 
514 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 
514 aa  544  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 
518 aa  543  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  54.6 
 
 
511 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 
514 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  53.33 
 
 
513 aa  541  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  54.96 
 
 
521 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 
521 aa  538  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  54.92 
 
 
513 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 
514 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  53.42 
 
 
511 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 
514 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 
514 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.66 
 
 
510 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 
514 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 
509 aa  535  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 
509 aa  535  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 
529 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 
514 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 
514 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  50.87 
 
 
533 aa  535  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 
514 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  52.55 
 
 
514 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0439  phosphoglyceromutase  54.8 
 
 
557 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1516  phosphoglyceromutase  54.04 
 
 
511 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0683605  decreased coverage  0.000804177 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  52.62 
 
 
514 aa  536  1e-151  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  52.76 
 
 
510 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
509 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  52.45 
 
 
514 aa  535  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
509 aa  531  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
509 aa  531  1e-150  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 
514 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
509 aa  531  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 
514 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  51.18 
 
 
515 aa  533  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 
514 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  52.64 
 
 
514 aa  532  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 
515 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
509 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
517 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
509 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 
509 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
515 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  52.14 
 
 
532 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  52.14 
 
 
532 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
509 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  51.16 
 
 
542 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  52.44 
 
 
514 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 
514 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50.96 
 
 
532 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
514 aa  526  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>