239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1141 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  100 
 
 
524 aa  1073    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  59.09 
 
 
510 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1516  phosphoglyceromutase  58.86 
 
 
511 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0683605  decreased coverage  0.000804177 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 
512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  55.11 
 
 
521 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  54.26 
 
 
516 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  55.4 
 
 
510 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0439  phosphoglyceromutase  55.47 
 
 
557 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  54.04 
 
 
511 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 
513 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  54.1 
 
 
512 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  53.85 
 
 
514 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  55.99 
 
 
513 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  51.56 
 
 
512 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.13 
 
 
516 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  54.03 
 
 
512 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  52.73 
 
 
512 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.33 
 
 
516 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  52.15 
 
 
512 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  52.75 
 
 
513 aa  527  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  52.13 
 
 
516 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
517 aa  522  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
525 aa  521  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
513 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  50 
 
 
509 aa  521  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
511 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
516 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 
512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  52.73 
 
 
505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
509 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 
509 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 
512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  51.75 
 
 
509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 
509 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 
512 aa  512  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 
512 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 
509 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
509 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
533 aa  510  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 
514 aa  508  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
518 aa  511  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.56 
 
 
510 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
511 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  51.45 
 
 
532 aa  506  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
516 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
513 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  49.53 
 
 
532 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 
521 aa  498  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
523 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 
518 aa  500  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
509 aa  495  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 
532 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  48.05 
 
 
513 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  50 
 
 
514 aa  493  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 
517 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  48.88 
 
 
538 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  48.12 
 
 
505 aa  493  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  49.23 
 
 
532 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  49.23 
 
 
532 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  48.94 
 
 
524 aa  488  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  48.91 
 
 
506 aa  486  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 
511 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 
510 aa  482  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
515 aa  484  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  48.63 
 
 
511 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  47.86 
 
 
506 aa  482  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 
514 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  47.17 
 
 
511 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  49.32 
 
 
511 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  49.42 
 
 
525 aa  480  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  48.05 
 
 
513 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  47.54 
 
 
511 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  48.04 
 
 
511 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  48.03 
 
 
514 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  47.83 
 
 
514 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  50.97 
 
 
532 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1776  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 
523 aa  476  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.403948  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
514 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 
514 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0622  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  50.88 
 
 
507 aa  478  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  48.05 
 
 
515 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 
514 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 
519 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  47.86 
 
 
519 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  46.51 
 
 
514 aa  472  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  48.73 
 
 
514 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  47.86 
 
 
515 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  45.28 
 
 
540 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  47.84 
 
 
507 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
514 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  48.14 
 
 
519 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 
514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 
532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
523 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>