230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1757 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 513 aa  1050    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1516  phosphoglyceromutase  62.28 
 
 		 511 aa  631  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0683605  decreased coverage  0.000804177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0439  phosphoglyceromutase  61.77 
 
 		 557 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  58.46 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  57.43 
 
 		 521 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  52.83 
 
 		 511 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  55.95 
 
 		 514 aa  549  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  54.99 
 
 		 524 aa  550  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  52.36 
 
 		 512 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 		 512 aa  531  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  53.35 
 
 		 509 aa  531  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  51.86 
 
 		 512 aa  531  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  52.95 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 		 512 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  51.57 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  52.76 
 
 		 510 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 513 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  53.35 
 
 		 513 aa  521  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  54.21 
 
 		 510 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 		 513 aa  518  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.44 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  50.88 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.63 
 
 		 516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  49.43 
 
 		 525 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.44 
 
 		 516 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  52.29 
 
 		 509 aa  508  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  52.25 
 
 		 513 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 		 517 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 		 514 aa  503  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  50.4 
 
 		 511 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  50.4 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  49.03 
 
 		 533 aa  498  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  52.44 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 514 aa  500  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 514 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 514 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  49.21 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  50.78 
 
 		 511 aa  495  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 		 514 aa  498  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 529 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 508 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  49.52 
 
 		 514 aa  491  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 511 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 532 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  51.18 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  47.67 
 
 		 520 aa  485  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  50.99 
 
 		 506 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.2 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  49.03 
 
 		 532 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  48.05 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 		 516 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  51.79 
 
 		 506 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  47.91 
 
 		 505 aa  483  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 523 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 		 521 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 509 aa  482  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  48.05 
 
 		 514 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  47.59 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  48.24 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  48.24 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 509 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 		 517 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  47.36 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 513 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 		 514 aa  478  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>