222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1516 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0439  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 557 aa  677    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1516  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 511 aa  1030    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0683605  decreased coverage  0.000804177 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  62.28 
 
 		 513 aa  631  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  58.55 
 
 		 521 aa  586  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  58.66 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  58.86 
 
 		 524 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  52.28 
 
 		 511 aa  546  1e-154  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  54.04 
 
 		 514 aa  525  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 		 512 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  53.35 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 512 aa  519  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  54.24 
 
 		 513 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50.58 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 512 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 		 516 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  52.06 
 
 		 512 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 		 516 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  50.88 
 
 		 511 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 518 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  51.47 
 
 		 505 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.17 
 
 		 515 aa  488  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 		 525 aa  485  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  50.89 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 512 aa  487  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  49.13 
 
 		 512 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 517 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 523 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  49.06 
 
 		 538 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  48.36 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 509 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 509 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  48.33 
 
 		 512 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 		 533 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 509 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 511 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 513 aa  477  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 509 aa  478  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  49.42 
 
 		 532 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  52.06 
 
 		 510 aa  471  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  48.55 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 		 509 aa  475  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 509 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  48.33 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  47.54 
 
 		 514 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 		 509 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  50.87 
 
 		 532 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  48.34 
 
 		 515 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 519 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 		 514 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 		 510 aa  465  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  47.45 
 
 		 505 aa  463  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  47.29 
 
 		 511 aa  462  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  48.94 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 521 aa  463  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  47.74 
 
 		 515 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 511 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 509 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 519 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  51.35 
 
 		 532 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 		 519 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 506 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  48.04 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 525 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 511 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  46.17 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  47.74 
 
 		 514 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 		 511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  47.67 
 
 		 517 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  47.51 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>