231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0822 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  100 
 
 
523 aa  1066    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  93.88 
 
 
524 aa  1014    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1890  phosphoglyceromutase  58.96 
 
 
540 aa  599  1e-170  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0882  phosphoglyceromutase  55.19 
 
 
542 aa  596  1e-169  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  56.29 
 
 
511 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  53.67 
 
 
512 aa  555  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  53.49 
 
 
512 aa  545  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  53.1 
 
 
512 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  53.17 
 
 
516 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  51.42 
 
 
525 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  52.2 
 
 
512 aa  530  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  51.26 
 
 
512 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 
512 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  51.54 
 
 
511 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.21 
 
 
516 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.21 
 
 
516 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  52.71 
 
 
505 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  53.4 
 
 
510 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  52.23 
 
 
513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  54.86 
 
 
509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 
512 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  49.32 
 
 
517 aa  512  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  52.87 
 
 
513 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  51.82 
 
 
516 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 
516 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 
512 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  50.97 
 
 
511 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  51.65 
 
 
514 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 
532 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 
532 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  52.31 
 
 
511 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  52.8 
 
 
513 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  50.86 
 
 
521 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  48.94 
 
 
518 aa  504  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.41 
 
 
510 aa  501  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  50.58 
 
 
514 aa  498  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 
521 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  49.04 
 
 
513 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
524 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  50.77 
 
 
512 aa  498  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 
532 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  47.67 
 
 
515 aa  498  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  49.23 
 
 
532 aa  496  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
512 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
509 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 
506 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  48.76 
 
 
514 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  48.46 
 
 
509 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  48.75 
 
 
533 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  50.77 
 
 
514 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
509 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 
511 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  48.19 
 
 
514 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
509 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  50 
 
 
518 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  48.57 
 
 
514 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
509 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  48.19 
 
 
514 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 
510 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  48.57 
 
 
514 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 
513 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  50 
 
 
510 aa  487  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
509 aa  486  1e-136  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
509 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  48.57 
 
 
514 aa  485  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
509 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
509 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
509 aa  487  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 
508 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
509 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
511 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  47.85 
 
 
538 aa  487  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  48.38 
 
 
514 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  48.38 
 
 
514 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  47.47 
 
 
505 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  47.7 
 
 
514 aa  482  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  50 
 
 
513 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  48.19 
 
 
514 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  48.19 
 
 
514 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  48.66 
 
 
542 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  49.14 
 
 
532 aa  480  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  48.85 
 
 
514 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.16 
 
 
515 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1516  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
511 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0683605  decreased coverage  0.000804177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  47.38 
 
 
506 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  49.62 
 
 
511 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  48.18 
 
 
514 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  49.62 
 
 
511 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  47.39 
 
 
510 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  47.7 
 
 
542 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  46.5 
 
 
505 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 
514 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  48.35 
 
 
516 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  46.5 
 
 
505 aa  475  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  46.33 
 
 
513 aa  473  1e-132  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  47.98 
 
 
510 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  47.67 
 
 
514 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  47.12 
 
 
510 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2472  phosphoglyceromutase  48.29 
 
 
528 aa  472  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  46.86 
 
 
514 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>