221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1196 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  63.46 
 
 		 510 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  59.96 
 
 		 507 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  65.94 
 
 		 506 aa  699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5029  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  60.92 
 
 		 525 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 506 aa  1055    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  61.11 
 
 		 505 aa  653    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  59.92 
 
 		 506 aa  626  1e-178  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0287  phosphoglyceromutase  55.45 
 
 		 507 aa  588  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.051699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  49.8 
 
 		 511 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  50.49 
 
 		 510 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 517 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 512 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 524 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 511 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  48.14 
 
 		 518 aa  483  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  47.17 
 
 		 516 aa  482  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  47.37 
 
 		 516 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 513 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 		 510 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  48.27 
 
 		 525 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 		 511 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  47.45 
 
 		 512 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  47.38 
 
 		 523 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  47.92 
 
 		 521 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  49.11 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  48.83 
 
 		 512 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  47.33 
 
 		 521 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  47.17 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 		 512 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  47.53 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  47.84 
 
 		 511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 511 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  47.73 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 		 512 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 510 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  48.04 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  48.04 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  47.25 
 
 		 513 aa  464  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  48.04 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 		 514 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  48.04 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  48.04 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  48.04 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  48.04 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 		 514 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  47.84 
 
 		 514 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  45.38 
 
 		 505 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 		 508 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  47.04 
 
 		 513 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 		 514 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  47.54 
 
 		 511 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 		 511 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  47.84 
 
 		 514 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  47.54 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  47.54 
 
 		 511 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  46.35 
 
 		 515 aa  458  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 509 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  47.66 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 		 514 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  44.47 
 
 		 518 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  46.14 
 
 		 524 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  45.16 
 
 		 520 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  47.54 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  45.49 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  47.45 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  47.35 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  47.54 
 
 		 514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 		 532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 		 515 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  47.45 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  47.14 
 
 		 513 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1516  phosphoglyceromutase  46.68 
 
 		 511 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0683605  decreased coverage  0.000804177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  47.45 
 
 		 514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  45.49 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  47.23 
 
 		 530 aa  451  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 514 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  46.18 
 
 		 552 aa  449  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  45.64 
 
 		 538 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 		 515 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0882  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 		 542 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  47.06 
 
 		 514 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  46.86 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  47.35 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>