242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1431 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  78.75 
 
 
552 aa  862    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  100 
 
 
530 aa  1097    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  79.51 
 
 
552 aa  887    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  59.38 
 
 
511 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  59.77 
 
 
515 aa  622  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  59.77 
 
 
511 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  59.57 
 
 
511 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  59.92 
 
 
514 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  59.92 
 
 
514 aa  615  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
514 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  59.73 
 
 
514 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
514 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
514 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
514 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  58.57 
 
 
514 aa  611  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  59.77 
 
 
515 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  58.24 
 
 
513 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
514 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  59.73 
 
 
514 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  58.43 
 
 
514 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  58.57 
 
 
514 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  58.57 
 
 
514 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  58.57 
 
 
514 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  59.19 
 
 
511 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  58.41 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  58.38 
 
 
514 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  58.8 
 
 
508 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  57.47 
 
 
514 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  57.47 
 
 
514 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  57.47 
 
 
514 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  57.47 
 
 
514 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  59.46 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  57.28 
 
 
514 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  57.74 
 
 
514 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  58.46 
 
 
514 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  57.85 
 
 
514 aa  601  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  57.69 
 
 
529 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  57.09 
 
 
514 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  57.09 
 
 
514 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  57.28 
 
 
515 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  56.9 
 
 
514 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  57.09 
 
 
515 aa  595  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  57.28 
 
 
515 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  57.17 
 
 
513 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  56.81 
 
 
514 aa  594  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  56.81 
 
 
514 aa  594  1e-168  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  57.61 
 
 
514 aa  593  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  58.49 
 
 
511 aa  588  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  56.67 
 
 
510 aa  588  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  58.3 
 
 
511 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  56.92 
 
 
516 aa  585  1e-166  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  56.12 
 
 
516 aa  578  1e-164  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  54.79 
 
 
514 aa  580  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  56.92 
 
 
519 aa  579  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  56 
 
 
520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  54.55 
 
 
510 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  55.71 
 
 
510 aa  571  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  53.74 
 
 
513 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  53.28 
 
 
517 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  55.94 
 
 
509 aa  554  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  52.99 
 
 
512 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  54.24 
 
 
525 aa  551  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  54.12 
 
 
511 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 
519 aa  545  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 
519 aa  544  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  53.64 
 
 
509 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  53.5 
 
 
521 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  54.98 
 
 
509 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  54.98 
 
 
509 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  52.88 
 
 
517 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  50.76 
 
 
525 aa  528  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
517 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  52.6 
 
 
505 aa  520  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  52.3 
 
 
512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  52.11 
 
 
512 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  51.26 
 
 
511 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  50.96 
 
 
512 aa  512  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  49.33 
 
 
518 aa  514  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  51.83 
 
 
514 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  51.83 
 
 
514 aa  511  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 
514 aa  508  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  50.47 
 
 
518 aa  508  1e-143  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  50.67 
 
 
512 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  50.48 
 
 
512 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  51.15 
 
 
510 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  49.62 
 
 
514 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 
516 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  51.16 
 
 
511 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  50.76 
 
 
516 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  49.52 
 
 
512 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.95 
 
 
516 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  49.52 
 
 
512 aa  495  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  50.58 
 
 
523 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  48.95 
 
 
515 aa  489  1e-137  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 
510 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
512 aa  487  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 
511 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  49.9 
 
 
514 aa  485  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  49.33 
 
 
509 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  50 
 
 
516 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>