223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3731 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  71.76 
 
 
510 aa  777    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  62.25 
 
 
506 aa  675    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  100 
 
 
506 aa  1042    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5029  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  67.88 
 
 
525 aa  743    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  65.94 
 
 
506 aa  699    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  62.5 
 
 
507 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  67 
 
 
505 aa  709    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0287  phosphoglyceromutase  57.51 
 
 
507 aa  629  1e-179  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.051699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  54.22 
 
 
510 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  53.03 
 
 
512 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 
512 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
513 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  50.3 
 
 
505 aa  513  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
514 aa  512  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
513 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 
517 aa  511  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  49.11 
 
 
511 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
512 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  51.28 
 
 
521 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 
512 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
512 aa  504  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  51.28 
 
 
511 aa  501  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  50.19 
 
 
512 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  48.83 
 
 
512 aa  496  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
511 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  49.31 
 
 
511 aa  496  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  51.46 
 
 
511 aa  495  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 
510 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 
512 aa  498  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0882  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 
542 aa  498  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
513 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  48.83 
 
 
516 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
516 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 
523 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  48.25 
 
 
514 aa  490  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 
514 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  49.11 
 
 
521 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 
516 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 
516 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
512 aa  488  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
518 aa  486  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  48.91 
 
 
524 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  49.13 
 
 
532 aa  486  1e-136  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 
510 aa  487  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  48.63 
 
 
513 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  45.78 
 
 
515 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  47.84 
 
 
509 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 
509 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 
509 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 
509 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 
509 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 
509 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 
509 aa  478  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
524 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 
509 aa  479  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 
516 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  48.83 
 
 
532 aa  479  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  47.81 
 
 
505 aa  475  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5239  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 
509 aa  476  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.372289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  48.08 
 
 
525 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  47.34 
 
 
513 aa  477  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3679  phosphoglyceromutase  47.36 
 
 
509 aa  477  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000585088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 
511 aa  477  1e-133  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  48.71 
 
 
516 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  47.36 
 
 
509 aa  477  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 
514 aa  474  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  47.15 
 
 
509 aa  472  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  48.74 
 
 
509 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  47.43 
 
 
513 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 
518 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  48.13 
 
 
511 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  46.84 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 
508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  46.59 
 
 
538 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  47.15 
 
 
515 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  47.74 
 
 
511 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  46.84 
 
 
505 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  47.94 
 
 
511 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  46.95 
 
 
514 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  47.35 
 
 
511 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  46.86 
 
 
515 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 
519 aa  465  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  46.78 
 
 
514 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
514 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  47.2 
 
 
533 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 
519 aa  464  1e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  48.53 
 
 
515 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  46.65 
 
 
513 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  46.46 
 
 
514 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.85 
 
 
514 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 
514 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  46.85 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  46.65 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
514 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 
514 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  46.46 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>