223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_18341 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0966  phosphoglyceromutase  97.05 
 
 
542 aa  1093    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15521  phosphoglyceromutase  70.59 
 
 
541 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0513  phosphoglyceromutase  64.65 
 
 
545 aa  746    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.272829  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2164  phosphoglyceromutase  66.23 
 
 
545 aa  763    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0638745  normal  0.146059 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  64.89 
 
 
540 aa  726    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  57.44 
 
 
532 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  57.44 
 
 
532 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  66.8 
 
 
540 aa  739    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16131  phosphoglyceromutase  67.56 
 
 
540 aa  743    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  100 
 
 
542 aa  1117    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05081  phosphoglyceromutase  70.21 
 
 
540 aa  807    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  66.41 
 
 
540 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  55.95 
 
 
532 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  56.11 
 
 
532 aa  618  1e-176  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  56.49 
 
 
532 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  54.88 
 
 
533 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  54.96 
 
 
532 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  55.73 
 
 
532 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  51.16 
 
 
514 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  48.95 
 
 
513 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  49.03 
 
 
513 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  46.37 
 
 
514 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  46.37 
 
 
514 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  50 
 
 
512 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
510 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  46.56 
 
 
514 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  53 
 
 
504 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
505 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  49.42 
 
 
512 aa  499  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  46.37 
 
 
514 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  49.42 
 
 
512 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  46.18 
 
 
514 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 
514 aa  500  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  45.99 
 
 
514 aa  497  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  45.99 
 
 
514 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.8 
 
 
514 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  45.99 
 
 
514 aa  497  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  45.99 
 
 
514 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 
514 aa  498  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 
517 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  46.37 
 
 
514 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  45.99 
 
 
514 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 
512 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  45.99 
 
 
514 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  45.99 
 
 
514 aa  497  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
512 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  47.5 
 
 
518 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  46.62 
 
 
512 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  49.52 
 
 
512 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  46.97 
 
 
529 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  46.32 
 
 
515 aa  489  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  46.97 
 
 
508 aa  491  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  47.67 
 
 
505 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  46.51 
 
 
515 aa  490  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  47.67 
 
 
505 aa  491  1e-137  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  48.16 
 
 
514 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 
509 aa  486  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  47.59 
 
 
509 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  48.55 
 
 
511 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  46.71 
 
 
514 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  47.53 
 
 
525 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1123  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  46.62 
 
 
513 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000726536  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 
504 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  47.27 
 
 
511 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  46.41 
 
 
514 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  46.12 
 
 
515 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 
514 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  46.12 
 
 
510 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  47.46 
 
 
510 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  46.68 
 
 
511 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  48.66 
 
 
523 aa  482  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  46.18 
 
 
510 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  47.01 
 
 
510 aa  485  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  48.75 
 
 
513 aa  485  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  51.06 
 
 
504 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  46.21 
 
 
514 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  46.21 
 
 
514 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  48.24 
 
 
505 aa  482  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  46.48 
 
 
511 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  47.59 
 
 
512 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
513 aa  480  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  45.74 
 
 
515 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  47.86 
 
 
514 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  47.67 
 
 
514 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  46.02 
 
 
514 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  49.03 
 
 
516 aa  478  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
519 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  46.41 
 
 
514 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  45.63 
 
 
514 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5702  phosphoglyceromutase  45.95 
 
 
509 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000339151  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  47.7 
 
 
524 aa  476  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  48.45 
 
 
512 aa  475  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  45.87 
 
 
516 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  47.87 
 
 
519 aa  476  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  45.68 
 
 
516 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
515 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 
514 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  45.83 
 
 
514 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  47.1 
 
 
516 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  46.12 
 
 
516 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>