239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0379 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0089  phosphoglyceromutase  70.52 
 
 
505 aa  677    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0359859  normal  0.664593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  68.06 
 
 
506 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  100 
 
 
504 aa  1019    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  68.13 
 
 
506 aa  677    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  66.27 
 
 
507 aa  644    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  68.26 
 
 
506 aa  655    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  68.66 
 
 
506 aa  672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  61.08 
 
 
505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  61.43 
 
 
504 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  60.44 
 
 
504 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  60.44 
 
 
504 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  58.45 
 
 
512 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  58.57 
 
 
523 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  56.75 
 
 
516 aa  529  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 
516 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
512 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 
512 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  51.19 
 
 
513 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
513 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
521 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  51.17 
 
 
516 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  48.74 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 
518 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  49.51 
 
 
517 aa  462  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 
512 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 
513 aa  465  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
514 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
517 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  50.69 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  47.87 
 
 
514 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  51.66 
 
 
513 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 
516 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
511 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  50 
 
 
513 aa  455  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  47.15 
 
 
514 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  48.64 
 
 
519 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 
516 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  47.38 
 
 
511 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  49.8 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 
509 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  51.18 
 
 
514 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0882  phosphoglyceromutase  47.57 
 
 
542 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  47.09 
 
 
514 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  49.7 
 
 
505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  49.41 
 
 
512 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  47.29 
 
 
514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 
510 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  47.75 
 
 
509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  48.26 
 
 
514 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 
519 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  47.95 
 
 
519 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  48.16 
 
 
514 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 
509 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  49.61 
 
 
514 aa  448  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 
513 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 
512 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  48.14 
 
 
510 aa  448  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
514 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
514 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 
510 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  48.06 
 
 
514 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  48.81 
 
 
511 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  47.2 
 
 
516 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  45.53 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  46.06 
 
 
514 aa  445  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  46.06 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  47.29 
 
 
514 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  45.53 
 
 
515 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  46.41 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  47.36 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  47.55 
 
 
506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  47.38 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 
521 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  48.83 
 
 
524 aa  443  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1890  phosphoglyceromutase  50.09 
 
 
540 aa  443  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 
515 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  49.22 
 
 
514 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  45.91 
 
 
514 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  45.71 
 
 
525 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  45.91 
 
 
514 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
515 aa  445  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  46.11 
 
 
514 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  46.88 
 
 
511 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  45.91 
 
 
514 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 
521 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  44.08 
 
 
540 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  49.71 
 
 
525 aa  441  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  47.16 
 
 
513 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  48.74 
 
 
532 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  45.91 
 
 
514 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  45.58 
 
 
514 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  47.07 
 
 
511 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  47.3 
 
 
552 aa  438  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 
514 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  45.33 
 
 
514 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>