More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1627 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  100 
 
 		 657 aa  1342    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  25.91 
 
 		 457 aa  118  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  30 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1701  sulfatase  28.87 
 
 		 483 aa  115  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1201  sulfatase, putative  25.13 
 
 		 507 aa  114  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.68416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  27.86 
 
 		 784 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0462  sulfatase, putative  25.74 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2553  sulfatase  26.27 
 
 		 520 aa  109  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  25.11 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  26.06 
 
 		 522 aa  104  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4747  sulfatase  25.21 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.833748  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  26.68 
 
 		 476 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3641  sulfatase  25.58 
 
 		 486 aa  97.4  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0528  sulfatase  24.12 
 
 		 487 aa  97.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  22.48 
 
 		 458 aa  94  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  25.95 
 
 		 509 aa  92  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3519  sulfatase  27.14 
 
 		 545 aa  90.9  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  26.48 
 
 		 480 aa  91.3  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2061  sulfatase  25.52 
 
 		 495 aa  90.9  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1102  sulfatase  25.77 
 
 		 506 aa  90.5  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0852605  normal  0.561012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3275  sulfatase  24.74 
 
 		 652 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0538  sulfatase  25 
 
 		 451 aa  90.1  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  25.5 
 
 		 508 aa  89.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.55 
 
 		 473 aa  88.2  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  22.8 
 
 		 523 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  24.21 
 
 		 1041 aa  87.8  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  24.8 
 
 		 873 aa  87  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  25.28 
 
 		 474 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  22.74 
 
 		 495 aa  85.1  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  23.81 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4305  sulfatase  24.95 
 
 		 512 aa  84.7  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  26.1 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  25.95 
 
 		 519 aa  84  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  24.09 
 
 		 515 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1088  sulfatase  23.58 
 
 		 495 aa  83.2  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3340  sulfatase  24.9 
 
 		 540 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  24.43 
 
 		 1009 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1070  sulfatase  24.52 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  23.09 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  26.45 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0533  sulfatase  26.12 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.270273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  26.45 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  25.33 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  25.19 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  23.64 
 
 		 511 aa  81.6  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  24.36 
 
 		 509 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  27.04 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  23.98 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  26.01 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  23.47 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  24.95 
 
 		 453 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  25.44 
 
 		 503 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  25.57 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  25.34 
 
 		 1065 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  26.38 
 
 		 510 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  23.62 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  24.94 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  20.32 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1890  sulfatase  23.7 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.461915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  23.27 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0536  sulfatase  24.63 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  26.32 
 
 		 536 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  25.63 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  26.35 
 
 		 493 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  21.86 
 
 		 559 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  23.06 
 
 		 587 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  24.79 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1436  sulfatase  24.46 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  25.11 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  22.65 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2135  sulfatase  27.91 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.0273474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  24.18 
 
 		 488 aa  74.7  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0661  sulfatase  22.73 
 
 		 646 aa  74.3  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  23.97 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  24.6 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1248  sulfatase  23.31 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  23.99 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  23.27 
 
 		 526 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4597  sulfatase  25.93 
 
 		 614 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0054  sulfatase  24.59 
 
 		 461 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  27.31 
 
 		 450 aa  72.8  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2283  sulfatase  27.91 
 
 		 693 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00157811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  22.02 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  21.24 
 
 		 672 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  24.11 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  22.25 
 
 		 520 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1843  sulfatase  28.85 
 
 		 826 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.10365 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3592  sulfatase  22.27 
 
 		 451 aa  72  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  23.28 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  29.01 
 
 		 671 aa  72.4  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  24.49 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.51 
 
 		 520 aa  72  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  23.91 
 
 		 478 aa  72  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  24.36 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  25.32 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  23.14 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  23.08 
 
 		 499 aa  71.2  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  22.9 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  23.74 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  25.3 
 
 		 765 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>