More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3340 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4305  sulfatase  88.28 
 
 
512 aa  934    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3340  sulfatase  100 
 
 
540 aa  1097    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171629  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1102  sulfatase  31.79 
 
 
506 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0852605  normal  0.561012 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1701  sulfatase  31.92 
 
 
483 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  31.73 
 
 
509 aa  187  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  30.93 
 
 
457 aa  180  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3519  sulfatase  34.32 
 
 
545 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1352  sulfatase  28.67 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3592  sulfatase  27.68 
 
 
451 aa  143  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0536  sulfatase  24.9 
 
 
473 aa  130  8.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  23.87 
 
 
784 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1066  sulfatase  27.88 
 
 
451 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.884442 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0538  sulfatase  26.17 
 
 
451 aa  126  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0533  sulfatase  27.42 
 
 
486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.270273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  25.94 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1210  sulfatase  25.5 
 
 
478 aa  111  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.200453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  26.05 
 
 
519 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  24.44 
 
 
496 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2135  sulfatase  27.27 
 
 
429 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  26.93 
 
 
522 aa  105  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1070  sulfatase  24.27 
 
 
463 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  24.76 
 
 
519 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  22.73 
 
 
492 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  26.93 
 
 
476 aa  100  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1436  sulfatase  25.55 
 
 
481 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314748  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.49 
 
 
508 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1363  sulfatase  23.65 
 
 
469 aa  97.8  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0156455  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2755  sulfatase  27.75 
 
 
473 aa  97.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.8787  normal  0.694021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  25.86 
 
 
497 aa  97.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1453  sulfatase  23.26 
 
 
450 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  24.76 
 
 
559 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  26.08 
 
 
497 aa  94.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0351  sulfatase  27.88 
 
 
419 aa  94.4  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0475  sulfatase  25.05 
 
 
434 aa  94  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  24.41 
 
 
564 aa  93.6  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  24.09 
 
 
486 aa  93.2  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  24.36 
 
 
565 aa  91.7  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  25.24 
 
 
489 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  26 
 
 
494 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1305  sulfatase  25.68 
 
 
491 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  25.2 
 
 
489 aa  90.5  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  24.6 
 
 
493 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  24.37 
 
 
508 aa  89.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  23.36 
 
 
447 aa  89  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2686  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 
490 aa  89.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  21.25 
 
 
587 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  22.67 
 
 
572 aa  87.4  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  22.34 
 
 
473 aa  87.4  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  22.69 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4036  sulfatase  24.04 
 
 
459 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0188862  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  23.87 
 
 
537 aa  84.7  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4747  sulfatase  26.15 
 
 
517 aa  84  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.833748  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  23.43 
 
 
549 aa  84  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  24.9 
 
 
657 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  23.24 
 
 
517 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2292  sulfatase  24.11 
 
 
489 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1235  sulfatase  25.98 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  28.11 
 
 
1009 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  24.51 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  25.16 
 
 
511 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  26.92 
 
 
511 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  25.05 
 
 
487 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  23.36 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  27.01 
 
 
516 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  26.23 
 
 
482 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0770  sulfatase  23.95 
 
 
486 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.119074  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5003  sulfatase  21.26 
 
 
533 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  23.17 
 
 
542 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  24.02 
 
 
536 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  25.61 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0661  sulfatase  26.02 
 
 
646 aa  79  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2973  sulfatase  25.85 
 
 
480 aa  79.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  27.79 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0528  sulfatase  23.47 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  25.61 
 
 
516 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  23.09 
 
 
510 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  25.61 
 
 
516 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0462  sulfatase, putative  25.14 
 
 
520 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  25.35 
 
 
518 aa  77.4  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  21.64 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4030  sulfatase  34.12 
 
 
765 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.868128  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  24.85 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  24.77 
 
 
523 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  22.46 
 
 
501 aa  77  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  24.4 
 
 
471 aa  77  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  23.14 
 
 
503 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  22.76 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  24.17 
 
 
498 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4646  sulfatase  22.85 
 
 
461 aa  76.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  24.9 
 
 
499 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5750  sulfatase  24.54 
 
 
505 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  25.06 
 
 
554 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  21.71 
 
 
539 aa  74.7  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  23.88 
 
 
631 aa  74.3  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  22.99 
 
 
594 aa  74.3  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  25.49 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  30.99 
 
 
672 aa  73.9  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  26.78 
 
 
1041 aa  73.2  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  22.05 
 
 
490 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1185  sulfatase  21.79 
 
 
495 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>