234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0268 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0484  phosphoglyceromutase  70.93 
 
 
492 aa  728    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.771416  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1510  phosphoglyceromutase  70.12 
 
 
492 aa  719    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  100 
 
 
492 aa  1008    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0460  phosphoglyceromutase  70.73 
 
 
492 aa  726    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1360  phosphoglyceromutase  62.6 
 
 
487 aa  629  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.467829  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0563  phosphoglyceromutase  62.27 
 
 
487 aa  622  1e-177  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1044  phosphoglyceromutase  61.59 
 
 
486 aa  617  1e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000497143  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1593  phosphoglyceromutase  61.82 
 
 
487 aa  617  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.102232  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1838  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  57.14 
 
 
496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  53.66 
 
 
491 aa  552  1e-156  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  44.82 
 
 
533 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  46.31 
 
 
506 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  45.08 
 
 
532 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  44.07 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  41.65 
 
 
516 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  44.71 
 
 
532 aa  412  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  41.45 
 
 
516 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 
512 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  45.94 
 
 
517 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  41.45 
 
 
516 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0120  phosphoglyceromutase  43.03 
 
 
513 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  44.29 
 
 
506 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  45.44 
 
 
514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  44.91 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.619962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  45.26 
 
 
512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  44.95 
 
 
512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  44.91 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  44.36 
 
 
512 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  41.26 
 
 
516 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  43.03 
 
 
515 aa  402  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  43.45 
 
 
510 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  44.11 
 
 
506 aa  405  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  44.05 
 
 
512 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  44.82 
 
 
511 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  45.05 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  42.2 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0133  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  42.39 
 
 
516 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  43.17 
 
 
513 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  43.63 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  43.87 
 
 
532 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  44.78 
 
 
505 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0222  phosphoglyceromutase  43.86 
 
 
516 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  43.81 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  43.45 
 
 
510 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  44 
 
 
511 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0287  phosphoglyceromutase  42.03 
 
 
507 aa  395  1e-109  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.051699 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  40.32 
 
 
516 aa  396  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  43.23 
 
 
521 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
511 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0523  phosphoglyceromutase  43.32 
 
 
501 aa  394  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.535701  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  43.5 
 
 
525 aa  392  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  43.4 
 
 
511 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  40.93 
 
 
504 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0475  phosphoglyceromutase  42.08 
 
 
507 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  42.66 
 
 
511 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  43.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  41.68 
 
 
511 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  42.86 
 
 
521 aa  392  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  41.04 
 
 
515 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  41.7 
 
 
514 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5029  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  42.47 
 
 
525 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
521 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  42.8 
 
 
511 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  42.05 
 
 
523 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0505  phosphoglyceromutase  42.83 
 
 
501 aa  388  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1073  phosphoglyceromutase  42.72 
 
 
538 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0159057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  43.54 
 
 
512 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  42.63 
 
 
516 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  43 
 
 
512 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  42.49 
 
 
514 aa  383  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  43.23 
 
 
532 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  41.7 
 
 
514 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0816  phosphoglyceromutase  44.09 
 
 
505 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  42.32 
 
 
516 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0800  phosphoglyceromutase  44.09 
 
 
505 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.763349  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  42.69 
 
 
513 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0445  phosphoglyceromutase  43.55 
 
 
505 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  40.24 
 
 
509 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  42.91 
 
 
540 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  40.12 
 
 
504 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  43 
 
 
518 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  39.84 
 
 
504 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  40.84 
 
 
515 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  40.48 
 
 
514 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  42.41 
 
 
511 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1492  phosphoglyceromutase  38.9 
 
 
507 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392134  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0469  phosphoglyceromutase  41.81 
 
 
532 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  41.6 
 
 
510 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  41.43 
 
 
506 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  41.97 
 
 
524 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1815  phosphoglyceromutase  38.9 
 
 
507 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.638605  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  40.2 
 
 
505 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  43.29 
 
 
511 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  41.15 
 
 
511 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  41.01 
 
 
514 aa  375  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  40.99 
 
 
511 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  40 
 
 
514 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  40.28 
 
 
525 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  40.76 
 
 
510 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16131  phosphoglyceromutase  42.15 
 
 
540 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>