43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3879 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  94.03 
 
 		 268 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  86.57 
 
 		 268 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  76.41 
 
 		 291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  77.61 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  76.12 
 
 		 278 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  76.12 
 
 		 268 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  76.12 
 
 		 273 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  72.35 
 
 		 274 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  74.53 
 
 		 269 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  71.7 
 
 		 274 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  73.78 
 
 		 269 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  72.73 
 
 		 265 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  61.17 
 
 		 274 aa  348  6e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  62.84 
 
 		 268 aa  348  6e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60.07 
 
 		 282 aa  336  2.9999999999999997e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  280  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  47.91 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  47.53 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  47.27 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  34.08 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  33.59 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.59 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.51 
 
 		 558 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.1 
 
 		 462 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  24.3 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.9 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  27.07 
 
 		 417 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  27.15 
 
 		 428 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.15 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.68 
 
 		 431 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  23.58 
 
 		 417 aa  49.7  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37402  predicted protein  33.33 
 
 		 890 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.174724  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.18 
 
 		 377 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.2 
 
 		 496 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.84 
 
 		 431 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  28.27 
 
 		 429 aa  46.2  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  23.56 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16070  uncharacterized AP superfamily protein  35.48 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.504413 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  23.43 
 
 		 713 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30785  predicted protein  26.67 
 
 		 999 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.778067 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  33.88 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  25.91 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>