41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0082 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 462 aa  964    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7260  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  68.65 
 
 		 456 aa  690    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104438  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  70.86 
 
 		 454 aa  685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  63.13 
 
 		 450 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1558  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  56.92 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2289  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  56.04 
 
 		 456 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0787093 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2469  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  56.64 
 
 		 467 aa  521  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00142832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  53.93 
 
 		 455 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.15 
 
 		 455 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0983  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.78 
 
 		 459 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.84 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0396  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  49.56 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  48.61 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  45.76 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.81 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  23.74 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.49 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.28 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  25.1 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  25.1 
 
 		 268 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.46 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.67 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.05 
 
 		 437 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  25.51 
 
 		 291 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  23.51 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  18.88 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.88 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  21.7 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  23.4 
 
 		 268 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  18.24 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  19.63 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.95 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.7 
 
 		 430 aa  47.8  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.6 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.97 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  19.31 
 
 		 437 aa  46.6  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  22.98 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.31 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.31 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.31 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  24.44 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>