84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1440 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
280 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  57.76 
 
 
279 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  53.17 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  46.3 
 
 
289 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  44.93 
 
 
287 aa  178  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  41.48 
 
 
531 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  39.49 
 
 
350 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.45 
 
 
519 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.24 
 
 
489 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.56 
 
 
304 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.85 
 
 
321 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.17 
 
 
413 aa  99.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  31.17 
 
 
413 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.91 
 
 
629 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.87 
 
 
414 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.4 
 
 
687 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.03 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  33.33 
 
 
416 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  29.25 
 
 
394 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.07 
 
 
415 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.76 
 
 
574 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  31.74 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27 
 
 
1967 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  22.91 
 
 
274 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  22.12 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.18 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.27 
 
 
499 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0869  hypothetical protein  29.67 
 
 
377 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.543973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.31 
 
 
499 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  26.87 
 
 
267 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  26.06 
 
 
676 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.57 
 
 
478 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  24.38 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  25.09 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  23.48 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  23.97 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  26.96 
 
 
269 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  23.77 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  28.06 
 
 
678 aa  53.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  24.35 
 
 
287 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.8 
 
 
558 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  26.12 
 
 
676 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  24.89 
 
 
713 aa  52  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  24.78 
 
 
417 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  26.52 
 
 
269 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  25.75 
 
 
291 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  25.86 
 
 
424 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  29.52 
 
 
422 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  23.04 
 
 
400 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  21.67 
 
 
429 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.46 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  24.14 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.01 
 
 
282 aa  49.3  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.29 
 
 
437 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.4 
 
 
455 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  20.23 
 
 
268 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2123  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.28 
 
 
388 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.98 
 
 
437 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.57 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.97 
 
 
558 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.89 
 
 
437 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.49 
 
 
437 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  19.85 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.39 
 
 
437 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2738  sulfatase  24.36 
 
 
427 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  26.58 
 
 
417 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.48 
 
 
433 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.39 
 
 
412 aa  45.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.49 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  25.68 
 
 
709 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.19 
 
 
509 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.22 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  25.88 
 
 
433 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.22 
 
 
278 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.82 
 
 
559 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.11 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2225  hypothetical protein  26.16 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  25.44 
 
 
433 aa  43.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  25.93 
 
 
706 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  22.09 
 
 
437 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.31 
 
 
416 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04783  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.44 
 
 
384 aa  42.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_51391  predicted protein  32.95 
 
 
645 aa  42.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644512  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3419  sulfatase  33.94 
 
 
526 aa  42.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>