41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3458 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  71.83 
 
 
629 aa  711    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
687 aa  1361    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  32.03 
 
 
531 aa  114  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.76 
 
 
489 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  30.25 
 
 
350 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.11 
 
 
321 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.83 
 
 
519 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.68 
 
 
289 aa  86.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.45 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.56 
 
 
414 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  27.53 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.4 
 
 
280 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  28.28 
 
 
394 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  28.69 
 
 
416 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.72 
 
 
304 aa  70.1  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.81 
 
 
415 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.59 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  26.81 
 
 
287 aa  60.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 
262 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.56 
 
 
558 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.32 
 
 
307 aa  53.9  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  37.75 
 
 
854 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.87 
 
 
1967 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  25.51 
 
 
569 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.66 
 
 
1056 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.57 
 
 
478 aa  51.6  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.65 
 
 
312 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  39.66 
 
 
3378 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  25.66 
 
 
676 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  31.62 
 
 
2816 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  22.59 
 
 
417 aa  49.3  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.9 
 
 
574 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  53.57 
 
 
1046 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  26.5 
 
 
676 aa  48.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1041  peptidase S15  28.28 
 
 
778 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.96 
 
 
2310 aa  47.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5243  hypothetical protein  51.85 
 
 
693 aa  45.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.751292  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  31.97 
 
 
666 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  24.6 
 
 
678 aa  45.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  24.19 
 
 
262 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5061  hypothetical protein  71.43 
 
 
284 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>