89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70997 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  100 
 
 
709 aa  1449    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  40.17 
 
 
713 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  33.77 
 
 
540 aa  249  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  34.67 
 
 
422 aa  223  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  31.14 
 
 
417 aa  193  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  30.75 
 
 
413 aa  188  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  30.4 
 
 
424 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  28.04 
 
 
428 aa  170  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  30.65 
 
 
400 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  32.51 
 
 
417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  27.25 
 
 
433 aa  165  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  27.25 
 
 
433 aa  163  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  29.49 
 
 
411 aa  160  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  30.56 
 
 
411 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  28.99 
 
 
447 aa  140  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04783  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  27.93 
 
 
384 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  23.88 
 
 
435 aa  63.9  0.000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.4 
 
 
433 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.09 
 
 
430 aa  61.2  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  23.66 
 
 
429 aa  60.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  24.1 
 
 
408 aa  58.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.44 
 
 
411 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.77 
 
 
385 aa  56.6  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.86 
 
 
455 aa  56.6  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 
496 aa  55.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24 
 
 
456 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  38.03 
 
 
427 aa  52.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.02 
 
 
312 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.8 
 
 
422 aa  52.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  27.41 
 
 
417 aa  52  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.89 
 
 
501 aa  51.2  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  31.3 
 
 
412 aa  50.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  34.52 
 
 
424 aa  50.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.3 
 
 
412 aa  50.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  35.63 
 
 
412 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  31.3 
 
 
412 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  34.48 
 
 
413 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  31.3 
 
 
412 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1775  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.45 
 
 
396 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.64 
 
 
416 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  31.3 
 
 
471 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.97 
 
 
437 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  25.31 
 
 
393 aa  48.9  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  37.14 
 
 
415 aa  49.3  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0396  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.35 
 
 
471 aa  48.5  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  21.09 
 
 
437 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.03 
 
 
437 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.91 
 
 
445 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.38 
 
 
437 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.03 
 
 
437 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.09 
 
 
437 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.03 
 
 
437 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  27.8 
 
 
377 aa  48.1  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.91 
 
 
684 aa  48.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  21.03 
 
 
437 aa  48.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20 
 
 
437 aa  47.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  31.43 
 
 
413 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.09 
 
 
437 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.63 
 
 
682 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  40.91 
 
 
437 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.38 
 
 
437 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.57 
 
 
435 aa  46.6  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  28.57 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  29.41 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  29.41 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  27.73 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.76 
 
 
434 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  26.07 
 
 
414 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  28.57 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  28.57 
 
 
436 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  36 
 
 
423 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.4 
 
 
489 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  31 
 
 
429 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.15 
 
 
387 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  30.59 
 
 
416 aa  45.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.68 
 
 
431 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.09 
 
 
450 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.68 
 
 
431 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.71 
 
 
385 aa  44.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  26.46 
 
 
531 aa  44.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.89 
 
 
412 aa  44.3  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  31.91 
 
 
423 aa  44.3  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  31.91 
 
 
423 aa  43.9  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  31.91 
 
 
423 aa  43.9  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  31.91 
 
 
423 aa  43.9  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  31.91 
 
 
423 aa  43.9  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  34.67 
 
 
429 aa  44.3  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0964  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.26 
 
 
412 aa  44.3  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  33.72 
 
 
421 aa  44.3  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>