40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6789 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 415 aa  865    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  55.88 
 
 		 413 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.8 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  25.94 
 
 		 413 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.67 
 
 		 519 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  24.71 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.2 
 
 		 321 aa  99.8  9e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  25.62 
 
 		 394 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.1 
 
 		 489 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.34 
 
 		 289 aa  86.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  27.53 
 
 		 531 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.64 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  25.09 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.07 
 
 		 280 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.81 
 
 		 687 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  24.67 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.4 
 
 		 629 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.32 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.08 
 
 		 574 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  23.18 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  21.64 
 
 		 695 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.2 
 
 		 1967 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  25.57 
 
 		 678 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  20.43 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  22.76 
 
 		 676 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  23.55 
 
 		 706 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  23.28 
 
 		 676 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 		 307 aa  50.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0869  hypothetical protein  25.08 
 
 		 377 aa  50.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.543973  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.39 
 
 		 312 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.67 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  22.4 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0268  phosphoglyceromutase  26.87 
 
 		 492 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  23.08 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl502  phosphoglyceromutase  22.51 
 
 		 532 aa  45.4  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0355  Phosphopentomutase  26.21 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.92 
 
 		 499 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23 
 
 		 499 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  27.21 
 
 		 504 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>