19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0661 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  60.11 
 
 
706 aa  793    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  100 
 
 
695 aa  1384    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  44.88 
 
 
676 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  45.32 
 
 
676 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  42.53 
 
 
678 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  30.66 
 
 
416 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  29.83 
 
 
413 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  28.77 
 
 
394 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.7 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.38 
 
 
321 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  27.08 
 
 
531 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.43 
 
 
413 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.64 
 
 
415 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.34 
 
 
519 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.1 
 
 
304 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.53 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.1 
 
 
453 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3025  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.62 
 
 
532 aa  44.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.19 
 
 
660 aa  44.3  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>