88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2550 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 321 aa  662    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.89 
 
 		 519 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.4 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  35.61 
 
 		 531 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  34.06 
 
 		 350 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.28 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.43 
 
 		 413 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  28.33 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.89 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.11 
 
 		 687 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.85 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  28.38 
 
 		 413 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  33.33 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.76 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.09 
 
 		 574 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  28.04 
 
 		 394 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.67 
 
 		 629 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.63 
 
 		 289 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  29.68 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.4 
 
 		 1967 aa  87  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.57 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.11 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.03 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.51 
 
 		 499 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  26.4 
 
 		 678 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  27.1 
 
 		 695 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  26.38 
 
 		 676 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.47 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  22.49 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  25.17 
 
 		 706 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  25.5 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.47 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  26.13 
 
 		 676 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  25 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  25 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.95 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.91 
 
 		 455 aa  59.7  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  25 
 
 		 427 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  23.55 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  25.5 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  26.97 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  24.01 
 
 		 447 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  35.06 
 
 		 411 aa  52.8  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  23.39 
 
 		 540 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.79 
 
 		 496 aa  49.7  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  27.74 
 
 		 517 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3574  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.33 
 
 		 426 aa  49.3  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4352  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.81 
 
 		 725 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  22.39 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.3 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.89 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  27.45 
 
 		 525 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.03 
 
 		 713 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  20.51 
 
 		 400 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  30.33 
 
 		 559 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  28.57 
 
 		 564 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.62 
 
 		 422 aa  46.2  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.9 
 
 		 558 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  21.32 
 
 		 429 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.33 
 
 		 559 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  23.84 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0869  hypothetical protein  20 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.543973  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  30.33 
 
 		 554 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.46 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  21.9 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.9 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  35.53 
 
 		 1041 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.9 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04783  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.56 
 
 		 384 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.79 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.27 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  32.91 
 
 		 504 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  31.03 
 
 		 540 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  28.7 
 
 		 506 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.14 
 
 		 456 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2671  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.74 
 
 		 665 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  21.07 
 
 		 437 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3820  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.23 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  28.48 
 
 		 516 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2675  hypothetical protein  25.26 
 
 		 665 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.03 
 
 		 660 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  34.18 
 
 		 504 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  24.89 
 
 		 261 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  26.43 
 
 		 517 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  23.71 
 
 		 265 aa  42.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.49 
 
 		 437 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  20.61 
 
 		 595 aa  42.4  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>