41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0968 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  850    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  96.19 
 
 		 394 aa  756    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  85.46 
 
 		 416 aa  674    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  32.98 
 
 		 678 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  29.83 
 
 		 695 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.87 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.69 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.18 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  29.12 
 
 		 706 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  29.01 
 
 		 676 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  33.2 
 
 		 531 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.28 
 
 		 304 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  29.01 
 
 		 676 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.13 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  29.78 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.22 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.9 
 
 		 489 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.79 
 
 		 289 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  28.18 
 
 		 262 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.18 
 
 		 629 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  31.5 
 
 		 1967 aa  83.6  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.77 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.03 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.53 
 
 		 687 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  28.7 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.83 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.06 
 
 		 574 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.63 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.03 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.68 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.44 
 
 		 307 aa  53.9  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.14 
 
 		 336 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  25.79 
 
 		 261 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  23.55 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  28.21 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  32.94 
 
 		 396 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  31.76 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.47 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  22.75 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  27.55 
 
 		 417 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2738  sulfatase  26.51 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.15562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>