18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7531 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  100 
 
 
706 aa  1404    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  62.04 
 
 
695 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  43.42 
 
 
676 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  42.4 
 
 
678 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  42.54 
 
 
676 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  30.25 
 
 
416 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  28.8 
 
 
413 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  29.18 
 
 
394 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.36 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.85 
 
 
413 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.16 
 
 
321 aa  59.7  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.18 
 
 
489 aa  57  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.95 
 
 
415 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.4 
 
 
574 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  24.59 
 
 
531 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.45 
 
 
519 aa  50.8  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.27 
 
 
304 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.43 
 
 
629 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>