67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1644 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
519 aa  1056    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  38.81 
 
 
531 aa  329  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.12 
 
 
489 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.89 
 
 
321 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  33.59 
 
 
350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.01 
 
 
304 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  30.21 
 
 
416 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  30.18 
 
 
413 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.45 
 
 
280 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  33.02 
 
 
262 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  29.27 
 
 
394 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.05 
 
 
413 aa  117  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.62 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.63 
 
 
414 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.67 
 
 
415 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.26 
 
 
279 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  32.38 
 
 
287 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.62 
 
 
687 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.11 
 
 
629 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.42 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.2 
 
 
262 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.93 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 
499 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  25.43 
 
 
400 aa  64.7  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  27.47 
 
 
417 aa  64.3  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.6 
 
 
574 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  25.34 
 
 
695 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  25 
 
 
676 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  25.61 
 
 
422 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 
478 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  24.25 
 
 
678 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  25.85 
 
 
676 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5730  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.47 
 
 
349 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2123  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.97 
 
 
388 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  27.65 
 
 
411 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.11 
 
 
509 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.48 
 
 
499 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.82 
 
 
433 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  21.79 
 
 
569 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  25.64 
 
 
433 aa  50.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  25.78 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  21.35 
 
 
706 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0329  sulfatase  23.44 
 
 
370 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  25.21 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  30.66 
 
 
504 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  24.11 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.38 
 
 
411 aa  48.5  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.31 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0653  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.61 
 
 
303 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00732097  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.94 
 
 
1967 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0622  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  28.87 
 
 
507 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  23.45 
 
 
447 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  24.07 
 
 
713 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.38 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.92 
 
 
336 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  23.94 
 
 
614 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13160  uncharacterized AP superfamily protein  40.62 
 
 
393 aa  45.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  24.8 
 
 
559 aa  44.7  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.97 
 
 
437 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  29.37 
 
 
511 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0304  hypothetical protein  26.45 
 
 
415 aa  44.3  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0921268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  31.54 
 
 
513 aa  44.7  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  33.33 
 
 
1065 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  32.59 
 
 
510 aa  44.3  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  28.47 
 
 
504 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1696  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.2 
 
 
393 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.384277 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  30 
 
 
505 aa  43.9  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>