36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0975 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  86.21 
 
 		 413 aa  674    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  849    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  85.41 
 
 		 394 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  34.04 
 
 		 678 aa  162  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  30.66 
 
 		 695 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.21 
 
 		 519 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.12 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  30.25 
 
 		 706 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.3 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  30.49 
 
 		 676 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.08 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  29.71 
 
 		 676 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  32.9 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.21 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  30.47 
 
 		 531 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.42 
 
 		 304 aa  99.8  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.4 
 
 		 489 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.17 
 
 		 1967 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.78 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.36 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.52 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.82 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  26.29 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.69 
 
 		 687 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  33.13 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.36 
 
 		 574 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.19 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.98 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 		 499 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.78 
 
 		 312 aa  54.3  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.16 
 
 		 307 aa  50.4  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.63 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  28.31 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  28.45 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.88 
 
 		 336 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  27.59 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>