54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6200 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 413 aa  862    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  69.73 
 
 		 414 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  55.88 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  27.87 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  26.89 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.05 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  26.19 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.31 
 
 		 321 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  28.12 
 
 		 531 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.72 
 
 		 289 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.17 
 
 		 280 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.84 
 
 		 489 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  23.79 
 
 		 350 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.35 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.77 
 
 		 687 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.45 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  25.25 
 
 		 678 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.46 
 
 		 629 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  24.9 
 
 		 262 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  24.57 
 
 		 706 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  23.78 
 
 		 695 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  23.97 
 
 		 676 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  22.49 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  22.66 
 
 		 676 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.64 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.41 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  22.18 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.95 
 
 		 509 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.32 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  20.96 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  21.62 
 
 		 265 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  19.5 
 
 		 262 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  20.59 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf597  phosphoglyceromutase  27.01 
 
 		 502 aa  49.7  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000713126  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  21.77 
 
 		 268 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  22.8 
 
 		 274 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  22.37 
 
 		 274 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1587  phosphoglyceromutase  30.47 
 
 		 522 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.264731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  22.81 
 
 		 274 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.2 
 
 		 478 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.1 
 
 		 312 aa  46.6  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3409  hypothetical protein  27.98 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl502  phosphoglyceromutase  21.8 
 
 		 532 aa  45.1  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  30.19 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1614  phosphoglyceromutase  27.08 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.108207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.53 
 
 		 499 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  21.77 
 
 		 268 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  22.76 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66043  predicted protein  29.13 
 
 		 1009 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  35.51 
 
 		 526 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  28.06 
 
 		 512 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0752  phosphoglyceromutase  23.91 
 
 		 531 aa  43.5  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.25 
 
 		 558 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>