51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000662 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  79.56 
 
 
268 aa  457  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  63.87 
 
 
282 aa  356  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  62.64 
 
 
268 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  63.37 
 
 
268 aa  348  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  61.17 
 
 
287 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  60.95 
 
 
291 aa  343  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60.95 
 
 
268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  60.15 
 
 
274 aa  333  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  60.22 
 
 
268 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  62.22 
 
 
265 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  59.85 
 
 
278 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  60.37 
 
 
274 aa  332  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  59.85 
 
 
273 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  61.31 
 
 
269 aa  332  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  60.58 
 
 
269 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  50.92 
 
 
267 aa  280  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  51.11 
 
 
268 aa  275  5e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  50.74 
 
 
268 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  42.08 
 
 
261 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  33.6 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  31.76 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.9 
 
 
499 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.46 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.31 
 
 
499 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.22 
 
 
312 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.55 
 
 
478 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  24.35 
 
 
350 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.77 
 
 
558 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.27 
 
 
445 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.1 
 
 
433 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37402  predicted protein  30.37 
 
 
890 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.174724  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  23.61 
 
 
713 aa  49.3  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.79 
 
 
431 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.05 
 
 
431 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30785  predicted protein  27.64 
 
 
999 aa  48.9  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.778067 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  26.81 
 
 
417 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.02 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.2 
 
 
496 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  26.34 
 
 
417 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.37 
 
 
413 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  24.68 
 
 
429 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  25 
 
 
400 aa  46.2  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  27.14 
 
 
531 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  29.85 
 
 
428 aa  45.8  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.34 
 
 
1967 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3481  hypothetical protein  25.45 
 
 
481 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.7 
 
 
414 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86507  major facilitator superfamily involved in the attachment of glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchors to proteins  26.47 
 
 
901 aa  42.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0578339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.83 
 
 
489 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>