42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1497 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
558 aa  1086    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  26.54 
 
 
274 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  27.07 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  27.56 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  26.2 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.46 
 
 
312 aa  67  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  27.11 
 
 
268 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  27.11 
 
 
268 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  28.97 
 
 
268 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  27.51 
 
 
287 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  28.33 
 
 
291 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  36.79 
 
 
531 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.63 
 
 
499 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.56 
 
 
687 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  26.67 
 
 
268 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.37 
 
 
499 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  26.23 
 
 
265 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66043  predicted protein  23.48 
 
 
1009 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06589  phosphoethanolamine N-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04290)  23.23 
 
 
1067 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0901607  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  22.77 
 
 
274 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.03 
 
 
282 aa  53.9  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.52 
 
 
336 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.07 
 
 
268 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  24.22 
 
 
278 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07049  GPI ethanolamine phosphate transferase 1 (EC 2.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXD1]  26.22 
 
 
930 aa  51.6  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.350863  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  27.67 
 
 
269 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.04 
 
 
478 aa  51.2  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  27.83 
 
 
261 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.07 
 
 
278 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.07 
 
 
273 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.07 
 
 
268 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.79 
 
 
629 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  26.77 
 
 
269 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  28.23 
 
 
350 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1402  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.5 
 
 
491 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.556587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.82 
 
 
280 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47390  predicted protein  26.88 
 
 
668 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02580  phosphoethanolamine N-methyltransferase, putative  22.51 
 
 
1037 aa  45.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37402  predicted protein  26.17 
 
 
890 aa  44.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.174724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.89 
 
 
304 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.76 
 
 
262 aa  43.9  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.16 
 
 
489 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>