52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  97.39 
 
 		 269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  74.16 
 
 		 268 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  73.41 
 
 		 268 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  73.78 
 
 		 287 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  72.39 
 
 		 291 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  74.16 
 
 		 268 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  73.03 
 
 		 278 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  73.03 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  73.03 
 
 		 273 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  75.76 
 
 		 265 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  70.34 
 
 		 274 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  70.08 
 
 		 274 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  60.58 
 
 		 274 aa  342  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  60.54 
 
 		 268 aa  329  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  59.7 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  53.41 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  52.85 
 
 		 268 aa  288  9e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  52.47 
 
 		 268 aa  284  8e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  50.79 
 
 		 261 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  39.21 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  33.58 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.09 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.1 
 
 		 478 aa  65.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.77 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.51 
 
 		 499 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.49 
 
 		 496 aa  58.9  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.64 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.96 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.16 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.87 
 
 		 431 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.31 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.04 
 
 		 431 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  22.92 
 
 		 350 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.19 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.19 
 
 		 422 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  30.2 
 
 		 428 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14460  uncharacterized AP superfamily protein  26.98 
 
 		 377 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.290718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  25.62 
 
 		 466 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  27.48 
 
 		 531 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  24.23 
 
 		 417 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.73 
 
 		 558 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1314  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.33 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.342243  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.15 
 
 		 307 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.62 
 
 		 372 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16070  uncharacterized AP superfamily protein  28.21 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  38.81 
 
 		 1967 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  23.73 
 
 		 417 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.98 
 
 		 416 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.02 
 
 		 437 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.75 
 
 		 437 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  25.64 
 
 		 262 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>