54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1398 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  48.25 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  49.6 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  47.27 
 
 
287 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  47.08 
 
 
268 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  48.26 
 
 
268 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  49.03 
 
 
291 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  45.08 
 
 
282 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.81 
 
 
278 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.81 
 
 
273 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.61 
 
 
268 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.81 
 
 
268 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  42.8 
 
 
268 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  50.79 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  50.4 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  46.48 
 
 
265 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  42.08 
 
 
274 aa  208  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  36.26 
 
 
267 aa  182  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  33.72 
 
 
268 aa  168  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1824  hypothetical protein  30.57 
 
 
278 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.044813  normal  0.779057 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1472  hypothetical protein  29.5 
 
 
265 aa  94  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.25 
 
 
499 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.62 
 
 
499 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.85 
 
 
478 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.36 
 
 
422 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.52 
 
 
558 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  25.79 
 
 
413 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  25.22 
 
 
350 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.09 
 
 
456 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  22.55 
 
 
1967 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  29.7 
 
 
531 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  26.13 
 
 
417 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.14 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.93 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3481  hypothetical protein  25.48 
 
 
481 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.32 
 
 
312 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.73 
 
 
433 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.19 
 
 
413 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.87 
 
 
496 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1851  phosphoglyceromutase  28.1 
 
 
521 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.238243 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  24.88 
 
 
417 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  25.61 
 
 
428 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.36 
 
 
411 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.31 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.62 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47390  predicted protein  29.11 
 
 
668 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  24.47 
 
 
394 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  24.75 
 
 
408 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.88 
 
 
558 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.03 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  23.64 
 
 
424 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66043  predicted protein  34.65 
 
 
1009 aa  42.7  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0622  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  26.14 
 
 
507 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>