67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3220 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 
408 aa  841    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  73.7 
 
 
411 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  70.76 
 
 
415 aa  586  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  68.6 
 
 
434 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  66.91 
 
 
413 aa  554  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  66.5 
 
 
412 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  66 
 
 
412 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  66.5 
 
 
471 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  66.25 
 
 
412 aa  544  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  65.76 
 
 
412 aa  544  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  66.5 
 
 
412 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  65.76 
 
 
437 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  63.97 
 
 
436 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  63.48 
 
 
436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  62.75 
 
 
436 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  63.24 
 
 
436 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  63.24 
 
 
436 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  65.77 
 
 
423 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  62.75 
 
 
435 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  64.32 
 
 
413 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  65.94 
 
 
429 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  65.46 
 
 
429 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  61.37 
 
 
436 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  61.5 
 
 
424 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  64.15 
 
 
423 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  64.15 
 
 
423 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  64.15 
 
 
423 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  64.15 
 
 
423 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  64.15 
 
 
413 aa  489  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  64.15 
 
 
423 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  63.9 
 
 
413 aa  485  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  48.52 
 
 
417 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  46.62 
 
 
416 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  48.28 
 
 
414 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  48.52 
 
 
421 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.74 
 
 
456 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  24.38 
 
 
713 aa  58.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  24.1 
 
 
709 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  24.56 
 
 
466 aa  55.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  23.51 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.4 
 
 
455 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.39 
 
 
455 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  26.14 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.19 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.27 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  23.55 
 
 
447 aa  50.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  24.38 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.94 
 
 
539 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.28 
 
 
455 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  32.93 
 
 
291 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  22.91 
 
 
540 aa  47.4  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.81 
 
 
262 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  25.93 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  30 
 
 
427 aa  46.6  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.09 
 
 
510 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.44 
 
 
462 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  21.78 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.2 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.55 
 
 
411 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.78 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  24.7 
 
 
268 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.31 
 
 
312 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.04 
 
 
499 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  24.75 
 
 
261 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0937  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.29 
 
 
610 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114509  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.53 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.15 
 
 
478 aa  42.7  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>