59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9252 on replicon NC_011984
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 		 417 aa  856    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  54.61 
 
 		 414 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  54.05 
 
 		 421 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  47.7 
 
 		 416 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  48.43 
 
 		 412 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  48.67 
 
 		 412 aa  388  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  49.88 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  48.67 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  48.67 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  49.39 
 
 		 411 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.92 
 
 		 412 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  47.94 
 
 		 412 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  48.52 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  49.52 
 
 		 415 aa  378  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  48.43 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  49.05 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.96 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  47.93 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.8 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  48.18 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  48.18 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  47.69 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  47.69 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  48.54 
 
 		 436 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  46.97 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  47.52 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  48.55 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  47.22 
 
 		 413 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  47.51 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  47.51 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  47.51 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  47.51 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  47.84 
 
 		 413 aa  333  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  47.51 
 
 		 423 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  47.84 
 
 		 413 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.02 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  26.69 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  26.26 
 
 		 540 aa  60.1  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  28.4 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.68 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  26.81 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.29 
 
 		 516 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  27.41 
 
 		 709 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2343  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.7 
 
 		 628 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  21.81 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  25 
 
 		 417 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  21.9 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.61 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.85 
 
 		 660 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.43 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  27 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.04 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  24.88 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.58 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.77 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.18 
 
 		 461 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.24 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.67 
 
 		 431 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  22.34 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>