47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1870 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  71.6 
 
 
436 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  74.82 
 
 
436 aa  660    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  73.58 
 
 
436 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  74.82 
 
 
436 aa  660    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 
429 aa  880    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  75.06 
 
 
436 aa  663    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  76.03 
 
 
413 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  75.36 
 
 
435 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  73.82 
 
 
436 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  83.22 
 
 
423 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  95.34 
 
 
429 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  74.4 
 
 
423 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  74.4 
 
 
423 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  74.4 
 
 
423 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  74.4 
 
 
423 aa  617  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  75.06 
 
 
413 aa  614  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  74.4 
 
 
423 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  71.29 
 
 
434 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  75.06 
 
 
413 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  68.51 
 
 
415 aa  564  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  66.91 
 
 
412 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  65.88 
 
 
471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  66.91 
 
 
412 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  67.39 
 
 
412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  66.67 
 
 
412 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  66.99 
 
 
412 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  66.83 
 
 
411 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  65.65 
 
 
437 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  66.1 
 
 
413 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  65.94 
 
 
408 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  57.49 
 
 
424 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  48.24 
 
 
417 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  46.21 
 
 
416 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  47.06 
 
 
421 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  46.41 
 
 
414 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.85 
 
 
455 aa  67  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  25.55 
 
 
540 aa  58.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.45 
 
 
713 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.4 
 
 
453 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.08 
 
 
456 aa  53.5  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  21.94 
 
 
447 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  22.91 
 
 
417 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.66 
 
 
496 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  38.36 
 
 
413 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.58 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  28.57 
 
 
709 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.2 
 
 
433 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>