66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3720 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
434 aa  893    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  68.3 
 
 
471 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  69.23 
 
 
412 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  69.23 
 
 
412 aa  594  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  68.03 
 
 
412 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  68.27 
 
 
412 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  71.05 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  69.27 
 
 
411 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  68.99 
 
 
412 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  71.29 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  68.6 
 
 
408 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  66.51 
 
 
437 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  68.28 
 
 
435 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  68.6 
 
 
415 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  69.64 
 
 
423 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  67.55 
 
 
436 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  67.31 
 
 
436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  67.31 
 
 
436 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  67.07 
 
 
436 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  66.83 
 
 
436 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  67.63 
 
 
413 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  66.5 
 
 
413 aa  545  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  65.38 
 
 
436 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  67.14 
 
 
423 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  67.14 
 
 
423 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  67.63 
 
 
413 aa  535  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  67.38 
 
 
423 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  67.14 
 
 
423 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  67.39 
 
 
413 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  67.14 
 
 
423 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  59.11 
 
 
424 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  47.39 
 
 
416 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  47.96 
 
 
417 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  48.82 
 
 
421 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  48.31 
 
 
414 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.76 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.93 
 
 
496 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.7 
 
 
455 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  22.82 
 
 
466 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  26.32 
 
 
413 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  26.5 
 
 
417 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.5 
 
 
539 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  25.51 
 
 
447 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.78 
 
 
467 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.11 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.33 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.3 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  35.14 
 
 
556 aa  50.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.79 
 
 
455 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.1 
 
 
478 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 
312 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.78 
 
 
456 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  23.76 
 
 
709 aa  47  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0937  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.09 
 
 
610 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114509  normal  0.737923 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.11 
 
 
713 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.57 
 
 
262 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.16 
 
 
509 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.43 
 
 
552 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1665  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.97 
 
 
568 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.785614  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.25 
 
 
499 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3360  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.62 
 
 
548 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.263432  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.81 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.18 
 
 
445 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.77 
 
 
499 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  36.84 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  28.46 
 
 
540 aa  43.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>