61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1096 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 
415 aa  846    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  70.76 
 
 
408 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  70.37 
 
 
411 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  68.6 
 
 
434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  69.15 
 
 
413 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  67.4 
 
 
436 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  67.4 
 
 
436 aa  557  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  66.09 
 
 
412 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  66.91 
 
 
436 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  66.91 
 
 
436 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  67.4 
 
 
435 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  66.09 
 
 
412 aa  557  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  69.01 
 
 
429 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  68.51 
 
 
429 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  66.67 
 
 
436 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  68.29 
 
 
423 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  65.1 
 
 
412 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  65.35 
 
 
412 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  65.35 
 
 
471 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  65.69 
 
 
436 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  65.59 
 
 
412 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  66.5 
 
 
413 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  65.35 
 
 
437 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  61.85 
 
 
424 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 
423 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 
413 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 
423 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 
423 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 
423 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  65.53 
 
 
423 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  65.53 
 
 
413 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  49.52 
 
 
417 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  46.25 
 
 
416 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  49.14 
 
 
421 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  46.67 
 
 
414 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.95 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.07 
 
 
456 aa  64.3  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  32.52 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  23.56 
 
 
447 aa  56.2  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.61 
 
 
713 aa  56.2  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.62 
 
 
422 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.94 
 
 
262 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.49 
 
 
312 aa  53.5  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  29.1 
 
 
419 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.24 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  34.48 
 
 
709 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  22.22 
 
 
540 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.89 
 
 
539 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.61 
 
 
454 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  21.92 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  22.82 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.85 
 
 
453 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.33 
 
 
534 aa  46.6  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  23.67 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.42 
 
 
499 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  32.5 
 
 
556 aa  44.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3820  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.4 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3574  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.44 
 
 
426 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  22.05 
 
 
466 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  21.58 
 
 
429 aa  43.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0470  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.69 
 
 
559 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000156785  hitchhiker  0.00144539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>