77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3142 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 
412 aa  841    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  95.87 
 
 
412 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  95.39 
 
 
437 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  92.96 
 
 
412 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  95.87 
 
 
412 aa  791    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  99.76 
 
 
471 aa  839    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  99.76 
 
 
412 aa  840    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  69.23 
 
 
434 aa  594  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  68.73 
 
 
411 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  67.4 
 
 
423 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  66.59 
 
 
436 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  66.5 
 
 
408 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  66.34 
 
 
436 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  65.28 
 
 
436 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  67.47 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  65.28 
 
 
436 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  65.28 
 
 
436 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  66.91 
 
 
429 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  65.04 
 
 
435 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  65.35 
 
 
415 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  64.55 
 
 
436 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  64.13 
 
 
413 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  61.23 
 
 
413 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  64.13 
 
 
423 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  64.37 
 
 
423 aa  499  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  64.13 
 
 
423 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  64.13 
 
 
423 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  64.13 
 
 
423 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  64.13 
 
 
413 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  64.29 
 
 
413 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  59.7 
 
 
424 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  48.67 
 
 
417 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  46.59 
 
 
416 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  46.94 
 
 
421 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  47.94 
 
 
414 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.69 
 
 
496 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  23.68 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.71 
 
 
455 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.81 
 
 
430 aa  56.2  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  23.95 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  21.46 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.62 
 
 
377 aa  53.5  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35 
 
 
510 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836124  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  26.78 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.32 
 
 
391 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.7 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  26.03 
 
 
447 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  31.3 
 
 
709 aa  50.1  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  25.81 
 
 
411 aa  49.7  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  25.09 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.71 
 
 
539 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.38 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  24.28 
 
 
540 aa  48.9  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  25.45 
 
 
422 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  28.21 
 
 
556 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.05 
 
 
455 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.46 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0937  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.93 
 
 
610 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114509  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.3 
 
 
467 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2945  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.85 
 
 
372 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.81 
 
 
713 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  30.51 
 
 
427 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.76 
 
 
456 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  24.73 
 
 
435 aa  46.6  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.72 
 
 
478 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  23.36 
 
 
466 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.48 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.3 
 
 
372 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.85 
 
 
312 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.76 
 
 
445 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.53 
 
 
552 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.03 
 
 
447 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  25.4 
 
 
268 aa  43.5  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29340  uncharacterized AP superfamily protein  25.67 
 
 
379 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3574  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.57 
 
 
426 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1402  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  38.03 
 
 
491 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.556587 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.33 
 
 
453 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>