62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4692 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 
413 aa  850    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  67.74 
 
 
411 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  69.15 
 
 
415 aa  558  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  66.91 
 
 
408 aa  554  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  66.5 
 
 
434 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  66.02 
 
 
436 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  65.78 
 
 
435 aa  529  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  65.94 
 
 
436 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  66.02 
 
 
436 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 
436 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  65.53 
 
 
436 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  66.09 
 
 
413 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  66.59 
 
 
423 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  66.1 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  65.37 
 
 
429 aa  511  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  61.98 
 
 
412 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  62.18 
 
 
424 aa  504  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  61.54 
 
 
412 aa  502  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  60.29 
 
 
471 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  61.23 
 
 
412 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  63.21 
 
 
436 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  61.23 
 
 
412 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  61.23 
 
 
412 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  65.19 
 
 
413 aa  494  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  65.19 
 
 
413 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  65.19 
 
 
423 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  65.19 
 
 
423 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  65.19 
 
 
423 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  65.43 
 
 
423 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  65.19 
 
 
423 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  61.48 
 
 
437 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  49.88 
 
 
417 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  47.57 
 
 
421 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  46.94 
 
 
416 aa  358  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  47.16 
 
 
414 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.92 
 
 
455 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.71 
 
 
509 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.05 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  23.89 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  25.56 
 
 
413 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.72 
 
 
422 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.43 
 
 
445 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  34.48 
 
 
709 aa  50.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.84 
 
 
433 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.41 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.48 
 
 
496 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  30.77 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3574  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.5 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  24 
 
 
713 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2142  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.23 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  21.48 
 
 
447 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  20.25 
 
 
417 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  40 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.77 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0937  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.18 
 
 
610 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114509  normal  0.737923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1418  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.27 
 
 
412 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.22 
 
 
478 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  33.71 
 
 
411 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.94 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  23.72 
 
 
540 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  19.31 
 
 
431 aa  43.5  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  21.9 
 
 
429 aa  43.1  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>