72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5876 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 411 aa  850    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  73.7 
 
 		 408 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  70.37 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  69.27 
 
 		 434 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  68.24 
 
 		 412 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  68.24 
 
 		 412 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  68.73 
 
 		 412 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  68.73 
 
 		 471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  68.73 
 
 		 412 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  68.98 
 
 		 412 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  68.49 
 
 		 437 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  67.74 
 
 		 413 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  65.69 
 
 		 436 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  65.44 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  64.95 
 
 		 436 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  65.44 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  65.44 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  64.95 
 
 		 436 aa  524  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  67.57 
 
 		 413 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  66.35 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  67.55 
 
 		 429 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  65.53 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  62.01 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  65.78 
 
 		 423 aa  495  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  66.67 
 
 		 413 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  61.62 
 
 		 424 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  65.69 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  66.42 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  49.39 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  48.83 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  47.16 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  46.72 
 
 		 414 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  28.41 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.32 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  25.78 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  26.4 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.04 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  24.07 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  23.89 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  27.44 
 
 		 709 aa  57.8  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.67 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.81 
 
 		 713 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  23.74 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.09 
 
 		 539 aa  53.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.3 
 
 		 510 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.21 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  24.44 
 
 		 540 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1155  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.21 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266632  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25 
 
 		 312 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.62 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  28.93 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1468  hypothetical protein  25.96 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15860  uncharacterized AP superfamily protein  27.37 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.070607  normal  0.0727207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.49 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.3 
 
 		 499 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3008  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.51 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4133  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.87 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0770784  hitchhiker  0.0000385329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.62 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.46 
 
 		 262 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.51 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  24.36 
 
 		 261 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  24.08 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  22.35 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.23 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  24.11 
 
 		 424 aa  44.3  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4867  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.83 
 
 		 660 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.31 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0338908  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1117  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.84 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>