56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5338 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 509 aa  1043    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4913  hypothetical protein  24.56 
 
 		 619 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3586  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.61 
 
 		 616 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4352  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.96 
 
 		 725 aa  87.4  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4485  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.96 
 
 		 683 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000194972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.62 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  22.58 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  22.25 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.13 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.39 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  26.07 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  24.18 
 
 		 540 aa  59.7  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  26.71 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.46 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  23.97 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  21.55 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.55 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  34.67 
 
 		 713 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.67 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.62 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  34.83 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  23.96 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.3 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.58 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.11 
 
 		 519 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  26.32 
 
 		 411 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0839592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  24.24 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.29 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.44 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.24 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.24 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2397  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.46 
 
 		 581 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  24.24 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  24.24 
 
 		 437 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.81 
 
 		 431 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  22.13 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.43 
 
 		 456 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.05 
 
 		 312 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.83 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.32 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.62 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.9 
 
 		 434 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.64 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29 
 
 		 455 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  26.76 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  22.61 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.9 
 
 		 552 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.16 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  33.33 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  19.19 
 
 		 304 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7065  hypothetical protein  24.11 
 
 		 371 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  24.07 
 
 		 400 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0247  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.76 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.05 
 
 		 682 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  35.71 
 
 		 459 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  26.14 
 
 		 402 aa  43.9  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>