57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2459 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
434 aa  852    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.18 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  27.67 
 
 
411 aa  76.3  0.0000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.11 
 
 
496 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  22.87 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  24.65 
 
 
556 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.43 
 
 
445 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3820  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.02 
 
 
398 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.88 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3574  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.47 
 
 
426 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.46 
 
 
437 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3007  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.41 
 
 
557 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.39 
 
 
478 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  18.91 
 
 
437 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.38 
 
 
437 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  39.29 
 
 
421 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  20.38 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.04 
 
 
499 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  28.17 
 
 
414 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2275  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.81 
 
 
544 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.68 
 
 
312 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8057  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.72 
 
 
557 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  20 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20 
 
 
437 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  18.74 
 
 
437 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  26.84 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3004  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.63 
 
 
562 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 
430 aa  47.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  18.74 
 
 
437 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.43 
 
 
552 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  24.18 
 
 
447 aa  47  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  22.05 
 
 
429 aa  47  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.83 
 
 
456 aa  46.6  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.44 
 
 
499 aa  46.6  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  31.87 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  27.47 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  23.99 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2981  putative alkaline phosphatase  23.87 
 
 
571 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882941  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.49 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4485  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.71 
 
 
683 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000194972 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4352  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.71 
 
 
725 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268784  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.71 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.58 
 
 
411 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  27.27 
 
 
531 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2730  putative phosphodiesterase-nucleotide pyrophosphatase  41.54 
 
 
744 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.204405  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.54 
 
 
519 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  48.89 
 
 
502 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3006  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.88 
 
 
541 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  34.62 
 
 
567 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  38 
 
 
522 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4926  sulfatase  32.73 
 
 
534 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.31 
 
 
437 aa  43.5  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  43.4 
 
 
489 aa  43.1  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.79 
 
 
509 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1594  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.65 
 
 
514 aa  43.1  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.867212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>