24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3007 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3007  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 557 aa  1152    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3006  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  71.93 
 
 		 541 aa  795    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3004  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.48 
 
 		 562 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2275  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.31 
 
 		 544 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1665  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  49.24 
 
 		 568 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.785614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  45.26 
 
 		 552 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1165  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  45.7 
 
 		 555 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3360  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  46 
 
 		 548 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.263432  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.42 
 
 		 545 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135671 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  43.66 
 
 		 556 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.35 
 
 		 539 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2981  putative alkaline phosphatase  35.24 
 
 		 571 aa  329  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1819  hypothetical protein  33.9 
 
 		 545 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1818  hypothetical protein  33.71 
 
 		 545 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1743  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.84 
 
 		 577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0812023  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0390  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.72 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.642333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1377  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.36 
 
 		 562 aa  173  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2790  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.95 
 
 		 565 aa  170  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0567243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4606  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.34 
 
 		 583 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2397  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.1 
 
 		 581 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0515  hypothetical protein  26.52 
 
 		 531 aa  157  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00486744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0044  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.41 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.41 
 
 		 434 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.48 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>