28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1165 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1165  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
555 aa  1161    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1665  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  57.69 
 
 
568 aa  672    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.785614  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.18 
 
 
552 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3360  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.98 
 
 
548 aa  627  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.263432  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  52.64 
 
 
545 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3004  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  44.39 
 
 
562 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3006  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.29 
 
 
541 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3007  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  45.7 
 
 
557 aa  479  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  41.55 
 
 
556 aa  464  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2275  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  43.78 
 
 
544 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.52 
 
 
539 aa  432  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2981  putative alkaline phosphatase  33.21 
 
 
571 aa  306  4.0000000000000004e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882941  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1818  hypothetical protein  33.52 
 
 
545 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1819  hypothetical protein  33.14 
 
 
545 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0390  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.1 
 
 
531 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.642333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1743  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.2 
 
 
577 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0812023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1377  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.52 
 
 
562 aa  196  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4606  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.23 
 
 
583 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2397  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.23 
 
 
581 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0515  hypothetical protein  25.86 
 
 
531 aa  152  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00486744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2790  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.34 
 
 
565 aa  151  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0567243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0044  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.76 
 
 
561 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  25.93 
 
 
417 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  35.87 
 
 
413 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4910  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.55 
 
 
682 aa  44.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  28.91 
 
 
713 aa  45.1  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  29.27 
 
 
413 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.26 
 
 
312 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>