23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0390 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0390  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
531 aa  1097    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.642333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3004  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.51 
 
 
562 aa  290  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1165  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.39 
 
 
555 aa  277  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  33.72 
 
 
556 aa  274  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1665  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.53 
 
 
568 aa  273  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.785614  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1357  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.49 
 
 
552 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.882864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3360  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.46 
 
 
548 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.263432  normal  0.164885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2981  putative alkaline phosphatase  32.09 
 
 
571 aa  263  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1819  hypothetical protein  32.97 
 
 
545 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1818  hypothetical protein  32.55 
 
 
545 aa  262  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2275  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.21 
 
 
544 aa  256  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3006  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.61 
 
 
541 aa  253  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3007  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  33.72 
 
 
557 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0023  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.24 
 
 
539 aa  238  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0724  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.51 
 
 
545 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1743  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.97 
 
 
577 aa  213  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0812023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1377  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.57 
 
 
562 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2397  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.32 
 
 
581 aa  156  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300063  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2790  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.17 
 
 
565 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0567243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4606  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.64 
 
 
583 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0044  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.42 
 
 
561 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_002950  PG0515  hypothetical protein  28.94 
 
 
531 aa  131  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00486744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  33.7 
 
 
417 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>