50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4972 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  87.13 
 
 
436 aa  783    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  97.71 
 
 
436 aa  871    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  95.41 
 
 
436 aa  855    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  97.71 
 
 
436 aa  871    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  94.5 
 
 
436 aa  850    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  79.17 
 
 
413 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  95.41 
 
 
435 aa  848    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 
436 aa  887    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  79.17 
 
 
413 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  77.7 
 
 
423 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  77.7 
 
 
423 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  75.72 
 
 
429 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  77.7 
 
 
423 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  77.7 
 
 
423 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  79.17 
 
 
413 aa  626  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  77.7 
 
 
423 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  73.7 
 
 
429 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  73.21 
 
 
423 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  67.07 
 
 
434 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  66.01 
 
 
412 aa  547  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  65.53 
 
 
412 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  64.79 
 
 
412 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  65.28 
 
 
471 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  65.28 
 
 
412 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  67.4 
 
 
415 aa  538  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  64.55 
 
 
412 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  65.69 
 
 
411 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  65.53 
 
 
413 aa  526  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  64.88 
 
 
437 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  62.75 
 
 
408 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  58.99 
 
 
424 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  47.69 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  48.44 
 
 
421 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  48.78 
 
 
414 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  44.66 
 
 
416 aa  343  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.24 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.29 
 
 
453 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  23.48 
 
 
447 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  33 
 
 
713 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  34.69 
 
 
540 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  26 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.86 
 
 
496 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.71 
 
 
422 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.78 
 
 
499 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  38.67 
 
 
413 aa  47  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  26.62 
 
 
556 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  28.57 
 
 
709 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.24 
 
 
411 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2150  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.32 
 
 
516 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.284263  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.83 
 
 
430 aa  43.1  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>