50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2012 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 		 499 aa  974    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5938  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.55 
 
 		 491 aa  213  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1690  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.99 
 
 		 490 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  28.32 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.21 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.46 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.49 
 
 		 455 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  27.46 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  27.46 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  27.46 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17270  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.53 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  27.66 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  24.4 
 
 		 412 aa  53.9  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  34.04 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  24.78 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  24.49 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.25 
 
 		 434 aa  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  24.49 
 
 		 436 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  23.42 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  27.46 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.49 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.45 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1211  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.92 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193412  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  36 
 
 		 423 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  24.39 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1244  hypothetical protein  22.92 
 
 		 381 aa  47.8  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  24.64 
 
 		 436 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  22.92 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  36 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4169  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.28 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  hitchhiker  0.00388008 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  36 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  19.06 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0636  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.8 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.288673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  34.25 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  35.23 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  31.76 
 
 		 350 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.17 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4352  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.94 
 
 		 725 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.268784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  34.21 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  30.93 
 
 		 416 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  31.58 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  32 
 
 		 413 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  32 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  31.58 
 
 		 413 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  32 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  33.73 
 
 		 421 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  32 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.29 
 
 		 450 aa  43.9  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.61 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.85 
 
 		 462 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>