45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0426 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7260  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  67.55 
 
 
456 aa  666    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000104438  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0426  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
450 aa  934    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.829269 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2886  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  64.9 
 
 
454 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0082  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  63.13 
 
 
462 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106273  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1558  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  56.48 
 
 
458 aa  552  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2289  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.73 
 
 
456 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0787093 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2469  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  54.95 
 
 
467 aa  532  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00142832  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2427  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  53.51 
 
 
455 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1823  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  53.51 
 
 
455 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0983  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.7 
 
 
459 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1148  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.02 
 
 
461 aa  449  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0396  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.96 
 
 
471 aa  438  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2330  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  47.77 
 
 
467 aa  431  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.302335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11140  uncharacterized AP superfamily protein  47.48 
 
 
466 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0415876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0776  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.77 
 
 
501 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.87 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.87 
 
 
437 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0713  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 
496 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.97 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.61 
 
 
437 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  23.87 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.87 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.87 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  22.92 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.21 
 
 
437 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.34 
 
 
437 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.99 
 
 
437 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.68 
 
 
437 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.18 
 
 
430 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0732  hypothetical protein  23.08 
 
 
429 aa  60.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.368831  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  20.94 
 
 
431 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.53 
 
 
431 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.8 
 
 
422 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1643  nucleotide diphosphatase  33.93 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0839592 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  22.4 
 
 
713 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3268  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.46 
 
 
602 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  21.91 
 
 
540 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  21.59 
 
 
402 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.71 
 
 
416 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  25.09 
 
 
709 aa  45.1  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  23.66 
 
 
417 aa  44.3  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  21.18 
 
 
422 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2592  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.6 
 
 
447 aa  43.5  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0697  hypothetical protein  20.3 
 
 
435 aa  43.5  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000533536  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2238  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.15 
 
 
403 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.321997  normal  0.249982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>