47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3071 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5185  phosphonoacetate hydrolase  94.72 
 
 		 436 aa  847    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0027169  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4972  phosphonoacetate hydrolase  97.71 
 
 		 436 aa  871    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00141978  normal  0.1555 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3427  phosphonoacetate hydrolase  86.9 
 
 		 436 aa  778    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619528  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0352  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  95.64 
 
 		 435 aa  846    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00675844  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  78.43 
 
 		 413 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5296  phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 		 436 aa  886    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000176941  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4657  phosphonoacetate hydrolase  95.18 
 
 		 436 aa  850    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00563019  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3071  phosphonoacetate hydrolase  100 
 
 		 436 aa  886    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000656592  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  76.98 
 
 		 423 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  76.98 
 
 		 423 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  76.98 
 
 		 423 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  76.98 
 
 		 423 aa  621  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1870  putative phosphonoacetate hydrolase  75.48 
 
 		 429 aa  622  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0317584  normal  0.311945 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  78.43 
 
 		 413 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  76.98 
 
 		 423 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  78.43 
 
 		 413 aa  619  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4794  phosphonoacetate hydrolase  73.7 
 
 		 429 aa  616  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000130224  hitchhiker  0.00000128506 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5070  phosphonoacetate hydrolase  73.21 
 
 		 423 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0927692  normal  0.212076 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  67.31 
 
 		 434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3134  phosphonoacetate hydrolase  65.77 
 
 		 412 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133169 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2529  phosphonoacetate hydrolase  65.28 
 
 		 471 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3194  phosphonoacetate hydrolase  64.79 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3158  phosphonoacetate hydrolase  65.53 
 
 		 412 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19589  normal  0.0309825 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3142  phosphonoacetate hydrolase  65.28 
 
 		 412 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1096  phosphonoacetate hydrolase  66.91 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6493  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  64.55 
 
 		 412 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000588943  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4692  phosphonoacetate hydrolase  66.02 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5876  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  65.44 
 
 		 411 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3077  phosphonoacetate hydrolase  64.63 
 
 		 437 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898295 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3220  phosphonoacetate hydrolase  63.24 
 
 		 408 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4875  phosphonoacetate hydrolase  59.24 
 
 		 424 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9252  phosphonoacetate hydrolase  48.18 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2339  phosphonoacetate hydrolase  48.92 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446144  normal  0.522386 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4258  phosphonoacetate hydrolase  49.51 
 
 		 414 aa  346  5e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17500  phosphonoacetate hydrolase  45.37 
 
 		 416 aa  339  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.63 
 
 		 455 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  24.35 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  23.97 
 
 		 713 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  25.56 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17290  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.52 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1449  phosphodiesterase I  26 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.982314  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 540 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.997572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  25.56 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  29.41 
 
 		 709 aa  46.2  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2012  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.49 
 
 		 499 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0949093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1960  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.36 
 
 		 534 aa  44.3  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.151896  hitchhiker  0.00177875 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07660  putative alkaline phosphatase  26.62 
 
 		 556 aa  43.5  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0307929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>